Comment bien collecter les données

Venons-en donc à l’essentiel: vous collectez les données nécessaires pour analyser votre question d’étude. Ci-après, nous discutons certains aspects importants pour faciliter le plus possible ce processus. Je vous recommande dans tous les cas de consulter avant toute chose le statisticien ou la statisticienne dans votre équipe. Cela vous évitera de saisir des données de manière incomplète ou dans un format erroné, ce qui peut s’accompagner d’un surcroît de travail considérable.

Suivant le design de l’étude, vous pouvez obtenir les données à partir de différentes sources. Une bonne possibilité consiste à exporter les données requises depuis le système d’information clinique. Cette manière de procéder est particulièrement adaptée pour les études rétrospectives et permet de saisir facilement de grands jeux de données. Ces données peuvent toutefois être lacunaires et ne tiennent d’ordinaire pas compte du point de vue du patient ou de la patiente.
Vous devez donc généralement compléter votre étude avec des questionnaires spécifiques destinés aux patientes et patients. Dans l’idéal, ces documents appelés PROM (patient-reported outcome measures) seront déjà établis et validés dans votre domaine de recherche. Cela vous permet de comparer vos résultats directement avec la littérature existante.
Les clichés radiologiques ou le matériel biologique, par exemple des informations génétiques, peuvent représenter d’autres sources importantes.

Un Case Report Form (CRF) désigne un questionnaire standardisé qui permet de saisir des données sur papier ou par voie électronique. Le CRF garantit que toutes les informations requises soient disponibles dans un format approprié pour toutes les personnes participant à l’étude. Vous devez établir le questionnaire durant la phase de planification du projet, idéalement en collaboration avec le statisticien ou la statisticienne qui procédera ensuite à l’analyse.

Pour les petites études avec une saisie manuelle des données, Excel est souvent la solution la plus simple. Vous recevrez probablement aussi des jeux de données plus importants provenant du système d’information clinique dans ce format.
Pour les études prospectives, en particulier lors d’enquêtes, je vous recommande d’utiliser REDCap, un logiciel spécialement développé pour de telles études. Ce système présente deux avantages: une sauvegarde sûre des données sur un serveur de l’université et la validation automatique de la saisie (p. ex. contrôle de la valeur minimale et maximale pour des données continues). Le service informatique de votre université pourra vous aider à préparer l’étude dans REDCap. Vous trouverez aussi de nombreux clips sur YouTube avec des instructions détaillées.

Vous devez dans tous les cas établir un document énumérant les principales définitions pour chaque variable. Parmi les définitions figurent le nom de la variable, une description des variables, le type de données, les unités et les éventuels commentaires (voir tableau).
Ce catalogue de données garantit que toutes les personnes participant à l’étude utilisent les mêmes définitions, en particulier pour les analyses statistiques.